负压吸引站是医疗机构废弃废液比较集中的地方，废气废液主要来源医疗机构的病患者，可能含有病毒，所以负压吸引站应当受到高度重视。一些医疗机构将负压吸引站与其他的站房（如液态氧站、空气压缩站等）设置在一起，若出现强烈的传染性疾病，负压吸引站将会成为一个潜在性的病原。所以，负压吸引站应布置在单独的地方。

另外，在治疗的过程中，负压吸引系统可能会有废液渗入，这些废液可能会携带病菌。因此，废液应当集中采集，然后送到污水处理站集中处理后，才能排入城市污水。若不便由污水处理站集中处理，应当在站内就地正确处理，达到城市污水排放标准后可排放到城市污水管网。废弃应当通过管道排到室外，排散口不能在医疗机构工作员流动区或聚集区，最好将排散口设置在医疗机构建筑物的楼顶。